Кафедра организована в 1919 году. За время своего существования находилась на базе ГБ№1 им. Н. И. Пирогова, учебного корпуса на Арцыбушевской 171, Клиник СамГМУ, морфологического корпуса СамГМУ. Кафедрой заведовали:
| 1919 | В. Ф. Войно-Ясенецкий | Прошёл по конкурсу на заведование кафедрой, но прибыть в Самару не смог |
| 1919-1925 | В. А. Гусынин | Доцент-хирург, возглавлял коллектив кафедры из трёх сотрудников. В мае 1922 был делегатом Всероссийского съезда хирургов |
| 1925-1935 | И. Г. Украинский | Доцент, научное направление кафедры «Пути распространения гноя при остеомиелите челюстей» |
| 1936-1937 | И. И. Колесниченко | |
| 1938-1940 | И. И. Голубев | Профессор, возглавлял коллектив кафедры из 8 сотрудников, из них двое были преподаваиелями. За учебный год на кафедре обучалось 338 студентов |
| 1940-1942 | Б. Д. Добычин | |
| 1942-1945 | В. И. Никифоров | Профессор, научное направление «Морфология огнестрельных ран конечностей» |
| 1945-1948 | Я. М. Романов | Доцент. Коллектив кафедры состоял из 9 сотрудников, из которых трое были ассистентами. Научное направление кафедры «Вопросы морфологии и нейрохирургии» |
| 1948-1966 | И. Н. Аскалонов | Профессор. Коллектив кафедры 11 сотрудников, из которых 5 преподавателей. Научное направление кафедры — «Принципы заживления огнестрельных ран конечностей». Выполнены 8 кандидатских и 1 докторская диссертации, на кафедре создан виварий |
| 1966-1974 | В. А. Белянский | Доцент. Коллектив кафедры состоял из 5 человек. Основное научное направление — «Общие закономерности морфогенеза и регенерации» |
| 1971-1974 | Н. Г. Вьюнышев | Доцент. Коллектив кафедры состоял из 9 ассистентов |
| 1974-1999 | В. Д. Иванова | Профессор. Научные направления кафедры — «Принципы ранней диагностики, профилактики и лечения заболеваний сердечно-сосудистой системы» (включая экспериментальную кардиохирургию), микроциркуляция |
| 1999-2007 | Кафедра реорганизована. Курс топографической анатомии передан кафедре нормальной анатомии (зав. доцент Гелашвили П.А.), курс оперативной хирургии — кафедре общей хирургии (зав. профессор Е.А. Столяров) | |
| С 2007 | А. В. Колсанов | Д.м.н., профессор РАН. Основное научное направление кафедры — информационные технологии в медицине. |
